Стремительное расширение рынка электронной торговли в Российской Федерации, достигшего по оценкам аналитического агентства Data Insight 11,2 трлн рублей в 2024 году, сопровождается формированием качественно новых рисков, обусловленных высокой интенсивностью технологических инноваций и усиливающейся конкуренцией между платформенными операторами. Предметом настоящего исследования являются теоретико-методологические подходы к идентификации, оценке и управлению рисками, возникающими при внедрении инновационных решений в электронные коммерческие услуги на отраслевом и региональном уровнях. В работе задействованы методы системного анализа научной литературы, сравнительного анализа концептуальных моделей риск-менеджмента, а также контент-анализа нормативно-правовых актов Российской Федерации в сфере платформенной экономики и информационной безопасности, а также таможенного законодательства, регламентирующего трансграничную электронную торговлю в рамках Евразийского экономического союза. Проведённый анализ позволил установить генезис научных представлений о рисках инноваций от классических работ до современных моделей цифровой трансформации, выявить закономерности трансформации рисковых факторов в условиях перехода от традиционных каналов продаж к мультиплатформенным экосистемам. Осуществлена систематизация ключевых категорий рисков, включая технологические, информационные, регуляторные, рыночные и таможенные с учётом специфики российской электронной торговли. Научная новизна заключается в разработке авторской классификации рисков внедрения инноваций в электронную коммерцию, дифференцированной по стадиям жизненного цикла инновационного решения и типу платформенного взаимодействия. Практическая значимость определяется возможностью использования полученных результатов при формировании систем риск-менеджмента операторами цифровых платформ, региональными органами управления и предприятиями малого и среднего бизнеса, осуществляющими деятельность в сфере электронной торговли.